密歇根州立大学 (MSU) 的研究人员正在牵头开展一项为期两年的研究，旨在更好地了解大肠杆菌 REPEXH02 的持久性。REPEXH02 是大肠杆菌 O157:H7 的一个亚型，与多起与绿叶蔬菜相关的食源性疾病暴发有关。该项目由农产品安全中心资助，旨在识别促成该菌株存活的遗传和环境因素，并开发一种预测工具，帮助种植者评估田间风险。
十年前，全基因组测序 (WGS) 首次将 REPEXH02 与多起疫情联系起来。尽管该菌株已被广泛检测到，但在环境中仍然相对罕见。目前正在进行的研究旨在确定 REPEXH02 持续存在的原因，以及环境条件如何可能支持其在绿叶蔬菜产区的生存。
该项目由密歇根州立大学食品科学与人类营养系副教授 Teresa Bergholz, Ph.D. 领导，共同首席研究员包括 Shannon Manning, Ph.D., M.P.H. 和 Jiyoon Yi, Ph.D.。Ph.D. Dr. Manning 专攻大肠杆菌生物信息学，而 Dr. Yi 则运用人工智能（AI）和机器学习（ML）工具进行预测建模。美国农业部农业研究局（USDA-ARS）的研究微生物学家 Michelle Carter, Ph.D. 为比较基因组分析提供了分离株。
2025 年 3 月，研究团队在绿叶蔬菜产区进行了基线采样，采集了土壤、沉积物、水和野生动物粪便样本。未发现大肠杆菌 O157:H7，研究人员认为这是由于灌溉前土壤干燥所致。从 11 月起，每月将继续进行土壤采样，分析重点包括土壤质地、pH值、可溶性盐、有机质和重金属。
研究人员正在重点研究砷耐受性，这种耐受性可能存在于 REPEXH02 的辅助基因组中，并可能有助于其更广泛的抗逆性。美国疾病控制与预防中心（CDC）此前已发现一些REPEXH02菌株表现出与砷耐受性相关的基因组变异。
Bergholz 博士和 Carter 博士正在对新分离株和存档分离株进行测序，以追踪该菌株的进化发展。研究团队将利用人工智能和机器学习技术，识别出能够区分 REPEXH02 与其他大肠杆菌亚型的环境和作物相关性状。
该项目的最终成果将是一个在线风险评估模型。该工具将允许种植者输入田间数据，例如土壤测试结果或野生动物活动情况，以评估 REPEXH02 存在的潜在风险。在正式发布之前，该工具将使用已知的阳性和阴性样本进行验证。
在 2025 年 4 月/5 月的《食品安全杂志》上发表的相关研究中，Bergholz 博士及其合作者 Joshua Owade 博士和 Jade Mitchell 博士研究了冷藏时间是否会影响绿叶蔬菜中大肠杆菌的休眠及其相关的食品安全风险。
